東吳大學EMBA高階經營碩士在職專班，課程設計分為「經營管理」、「數位轉型」、「智慧物流」三組，名額共計92名，畢業學分為36學分。三組課程包括共同必修、分組核心必修及共同選修三部份，三組的同學有機會共同上課、培養菁英人脈。
在分組核心必修方面，經營管理組七選四的課程包括【跨國企業研究專題】、【創新與創業】、【管理會計及財報分析】、【企業社會責任】、【行銷策略與服務管理】、【經營策略與領導】、【談判理論與實務】，數位轉型組七選四的課程包括【跨國企業研究專題】、【藍湖策略與數位轉型】、【智慧物聯網基礎與運用】、【雲端服務與大數據分析】、【社群網路分析與專案管理】、【數位行銷與商業策略】、【數位經濟與市場競爭】，智慧物流組七選四的課程包括【跨國企業研究專題】、【智慧物流規劃與設計】、【AI與智慧物流應用】、【企業經營商業模式】、【問題求解與決策分析】、【物流與運輸業經營管理研討】、【資安與AIoT智慧聯網應用專題】。共同選修包括精選課程，例如財經政策論壇、企業永續發展論壇、數位轉型管理講堂、智慧物流與供應鏈管理講堂、孫運璿講堂、及管理決策與執行力，另亦有【永續發展】、【管理思維】、【研究方法】、【全球視野】、【跨域多元】等選修模組課程。東吳大學EMBA提供高階經理人一個在職進修的平台，同時邀請產業界高階主管講授經營企業的策略，同學可以學習到不同產業的經營方式和不同策略的思考邏輯。
1. 課程：依前瞻、國際、實用三大導向而設計。
2. 教學：理論、實務、實作三者並重。經常安排企業參訪與企業論壇，讓學生能與企業家或成功領導人對話，也特別鼓勵學生以自己服務的企業為研究個案，撰寫學期報告和論文。
3. 時間：集中上課時間，隔週上課二至四天，讓學生更能兼顧學業、工作與家庭。
4. 前瞻：順應時代趨勢、滿足社會需求、開創國際視野，培養高效管理者。